MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_001880	CATAT	2	10	22658	22667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
502	NC_001880	AT	4	8	22664	22671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_001880	GAA	2	6	22707	22712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_001880	CAAA	2	8	22715	22722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_001880	A	6	6	22720	22725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_001880	A	6	6	22750	22755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_001880	AAG	2	6	22815	22820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_001880	T	6	6	22915	22920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_001880	GAA	3	9	22935	22943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_001880	AAC	2	6	22962	22967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_001880	TTAT	2	8	22980	22987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_001880	TTA	2	6	23009	23014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_001880	TTA	2	6	23103	23108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_001880	AAG	2	6	23130	23135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_001880	AAT	2	6	23193	23198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_001880	CTT	2	6	23301	23306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_001880	CAT	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_001880	AGA	2	6	23376	23381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_001880	AAG	2	6	23406	23411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_001880	CAT	2	6	23419	23424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_001880	TCC	2	6	23434	23439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_001880	AAG	2	6	23469	23474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_001880	GTAA	2	8	23490	23497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_001880	AAC	2	6	23578	23583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_001880	CCG	2	6	23599	23604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_001880	GTA	2	6	23704	23709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_001880	TAT	2	6	23837	23842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_001880	TTC	2	6	23843	23848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_001880	TTC	2	6	23878	23883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_001880	ATAA	2	8	23893	23900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_001880	T	7	7	23962	23968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_001880	GTTT	2	8	23978	23985	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_001880	TAC	2	6	23999	24004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_001880	CTT	2	6	24010	24015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_001880	TTA	2	6	24016	24021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_001880	TCT	2	6	24028	24033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_001880	T	6	6	24110	24115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_001880	GTAA	2	8	24153	24160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_001880	CTT	2	6	24210	24215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_001880	CCT	2	6	24216	24221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_001880	TAT	2	6	24227	24232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_001880	AG	3	6	24278	24283	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
543	NC_001880	CTC	2	6	24328	24333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957061
544	NC_001880	TTC	2	6	24376	24381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957061
545	NC_001880	ATA	2	6	24457	24462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957061
546	NC_001880	AGGTA	2	10	24489	24498	40 %	20 %	40 %	0 %	10957061
547	NC_001880	TTC	2	6	24503	24508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957061
548	NC_001880	TAA	2	6	24542	24547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957061
549	NC_001880	CGGGAA	2	12	24552	24563	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	10957061
550	NC_001880	TCT	3	9	24605	24613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957061
551	NC_001880	AG	3	6	24660	24665	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
552	NC_001880	TTTA	2	8	24688	24695	25 %	75 %	0 %	0 %	10957061
553	NC_001880	T	6	6	24701	24706	0 %	100 %	0 %	0 %	10957061
554	NC_001880	GAA	2	6	24707	24712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957061
555	NC_001880	CTC	2	6	24798	24803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957061
556	NC_001880	TGG	2	6	24881	24886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957062
557	NC_001880	GTA	2	6	24980	24985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957062
558	NC_001880	T	6	6	24988	24993	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
559	NC_001880	AAG	2	6	25022	25027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957062
560	NC_001880	ATTT	2	8	25078	25085	25 %	75 %	0 %	0 %	10957062
561	NC_001880	ATA	2	6	25152	25157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957062
562	NC_001880	TA	3	6	25208	25213	50 %	50 %	0 %	0 %	10957062
563	NC_001880	CAA	2	6	25267	25272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957062
564	NC_001880	A	6	6	25288	25293	100 %	0 %	0 %	0 %	10957062
565	NC_001880	TTC	2	6	25347	25352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957062
566	NC_001880	GAG	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957062
567	NC_001880	CTT	3	9	25391	25399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957062
568	NC_001880	TTC	2	6	25430	25435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957062
569	NC_001880	T	7	7	25442	25448	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
570	NC_001880	TAGTA	2	10	25498	25507	40 %	40 %	20 %	0 %	10957062
571	NC_001880	AAC	2	6	25517	25522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957062
572	NC_001880	T	6	6	25524	25529	0 %	100 %	0 %	0 %	10957062
573	NC_001880	TAC	2	6	25568	25573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_001880	T	6	6	25641	25646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_001880	TTA	2	6	25663	25668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_001880	TTC	2	6	25712	25717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_001880	ATT	2	6	25737	25742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957063
578	NC_001880	A	8	8	25745	25752	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
579	NC_001880	TTC	2	6	25819	25824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957063
580	NC_001880	GTAT	2	8	25833	25840	25 %	50 %	25 %	0 %	10957063
581	NC_001880	GTA	2	6	25864	25869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957063
582	NC_001880	TCT	2	6	25907	25912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957063
583	NC_001880	CTT	2	6	25914	25919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957063
584	NC_001880	TTC	2	6	25969	25974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957063
585	NC_001880	AG	3	6	26033	26038	50 %	0 %	50 %	0 %	10957063
586	NC_001880	A	6	6	26166	26171	100 %	0 %	0 %	0 %	10957063
587	NC_001880	GTT	2	6	26172	26177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957063
588	NC_001880	ACT	2	6	26197	26202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_001880	ACTT	2	8	26257	26264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_001880	TA	3	6	26273	26278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_001880	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_001880	GGTA	2	8	26395	26402	25 %	25 %	50 %	0 %	10957064
593	NC_001880	GAA	2	6	26409	26414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957064
594	NC_001880	AT	3	6	26519	26524	50 %	50 %	0 %	0 %	10957064
595	NC_001880	TTA	2	6	26550	26555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957064
596	NC_001880	TTCC	2	8	26576	26583	0 %	50 %	0 %	50 %	10957064
597	NC_001880	GA	3	6	26611	26616	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
598	NC_001880	TTTTC	2	10	26621	26630	0 %	80 %	0 %	20 %	10957064
599	NC_001880	GTT	2	6	26706	26711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957064
600	NC_001880	CT	3	6	26805	26810	0 %	50 %	0 %	50 %	10957064
601	NC_001880	GTT	2	6	26849	26854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957064
602	NC_001880	AAGT	2	8	26973	26980	50 %	25 %	25 %	0 %	10957064
603	NC_001880	AG	3	6	26984	26989	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
604	NC_001880	CCTGG	2	10	27025	27034	0 %	20 %	40 %	40 %	10957064
605	NC_001880	CTT	2	6	27069	27074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957064
606	NC_001880	TTC	2	6	27082	27087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957064
607	NC_001880	TCTA	2	8	27137	27144	25 %	50 %	0 %	25 %	10957065
608	NC_001880	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
609	NC_001880	CTT	2	6	27213	27218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957065
610	NC_001880	GTA	2	6	27278	27283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957065
611	NC_001880	TC	3	6	27383	27388	0 %	50 %	0 %	50 %	10957065
612	NC_001880	TTC	2	6	27398	27403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957065
613	NC_001880	T	6	6	27423	27428	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
614	NC_001880	AT	3	6	27474	27479	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
615	NC_001880	ATT	2	6	27541	27546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957065
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617	NC_001880	A	6	6	27600	27605	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
618	NC_001880	TGAAG	2	10	27649	27658	40 %	20 %	40 %	0 %	10957065
619	NC_001880	A	6	6	27667	27672	100 %	0 %	0 %	0 %	10957065
620	NC_001880	ATC	2	6	27760	27765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957065
621	NC_001880	ATC	2	6	27829	27834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957065
622	NC_001880	T	6	6	27864	27869	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
623	NC_001880	T	6	6	27886	27891	0 %	100 %	0 %	0 %	10957065
624	NC_001880	TCA	2	6	27899	27904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957065
625	NC_001880	TAA	2	6	27920	27925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957065
626	NC_001880	TAT	2	6	28006	28011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_001880	ATT	2	6	28134	28139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_001880	TTC	2	6	28178	28183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_001880	CTT	2	6	28234	28239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_001880	TA	3	6	28261	28266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_001880	AT	3	6	28290	28295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_001880	TAATA	2	10	28313	28322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_001880	TAA	2	6	28365	28370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_001880	ATA	2	6	28420	28425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957066
635	NC_001880	TAA	2	6	28427	28432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957066
636	NC_001880	ATA	2	6	28584	28589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957066
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638	NC_001880	AAT	2	6	28663	28668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957066
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